Ekologisen luontotyyppiluokittelun mukaan voidaan tunnistaa hallinnollisesti luokiteltuja, turvattavia luontotyyppejä. Näitä ovat esimerkiksi luontodirektiivin luontotyypit, luonnonsuojelulain ja vesilain suojellut luontotyypit ja metsälain erityisen tärkeät elinympäristöt.